Otimização de desempenho de software para análise filogenética (ExaML) utilizando a arquitetura CUDA

Resumo

O aumento das bases genéticas de dados e da complexidade das análises filogenéticas requer maior poder computacional: este artigo apresenta o processo de reimplementação das principais funções da aplicação ExaML para a arquitetura CUDA, demonstrando aspectos relevantes no processo de otimização de uma aplicação de alto desempenho para GPU e apresentando bons resultados na manipulação de grandes entradas de dados.